基于DNABERT编码的启动子预测模型

摘要： 启动子是位于基因上游区域的特定DNA序列，通过识别和预测DNA序列中的启动子，可以更好地理解基因调控的机制，促进生物学和医学研究的进展。通过实验的方法来预测启动子既昂贵又费时，而通过计算方法进行启动子预测同样存在不足之处，如精度有待提升、序列编码方式所包含的信息量不足等。该文提出了一种新的编码方式，将预训练模型DNABERT应用于启动子预测的编码，并测试了使用不同深度学习模型进...