上海市崇明区猪—土壤界面微生态与抗生素耐药性相关性分析

摘要： 目的 探究养殖场内育肥猪粪便与土壤的微生物组成和抗生素耐药基因构成，并挖掘之间的关联。方法 选择上海市崇明区5家猪养殖场，采集猪粪便和土壤样本，使用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行全基因组鸟枪法测序。通过主坐标分析、LEfSe分析、共现网络分析和统计学检验，探究样本微生物组成、多样性特征和抗生素耐药基因之间的关系。结果 猪粪便中的主要微生物包括拟杆菌...