基于密度聚类的染色质拓扑相关结构域识别方法

摘要： 高通量染色质构象捕获（Hi-C）技术的快速发展为染色质结构分析提供了丰富的基因组位点间交互作用数据，但目前基于Hi-C数据的已有拓扑相关结构域（TAD）识别方法存在准确率低、参数敏感等问题。在此背景下，本文设计并实现了一种基于空间密度聚类的TAD识别方法。该方法首先对原始Hi-C数据进行预处理，得到归一化后的Hi-C接触矩阵数据；然后计算位点之间的距离矩阵，基于位点的核心距离和...