基于单细胞测序数据的拉克罗斯病毒感染神经系统细胞基因表达差异分析
医学信息
页数: 6 2024-09-01
摘要: 目的 分析受拉克罗斯病毒(LACV)感染的人脑类器官细胞不同亚群相关基因表达差异,揭示不同亚群之间的转录组特性。方法 选择GEO数据库中编号为GSE131434的单细胞转录组数据,包含2个样本,1个为模拟感染COs的作为阴性对照组,1个为受LACV感染的COs。采用R语言“seurat”包对数据进行过滤、归一化、主成分分析、UMAP聚类分析,寻找COs亚群。通过“SingleR...