红光、蓝光处理下马铃薯转录组特异表达基因密码子的偏好性分析

摘要： 以红光、蓝光处理下的马铃薯转录组数据为基础，以白光为对照，各筛选出1 206条、691条特异表达基因。通过CodonW、CUSP对筛选出的基因编码序列(CDS)进行密码子使用偏好性分析。结果表明，在红光、蓝光处理下，马铃薯对基因密码子的使用偏好性都较弱，都偏好使用A或T(U)结尾的密码子。在2种光质处理下，特异表达基因序列密码子的GC总量都与同义密码子在第3位的胞嘧啶和鸟嘌呤含...