玉米RAV基因家族鉴定、密码子偏好性及表达分析

摘要： 利用RAV基因特有结构域，通过pfam和HMMER软件进行筛选剔除不完整或重复序列，从5个玉米自交系基因组中共鉴定出241个RAV家族成员，并使用邻接法构建系统进化树，将玉米和拟南芥RAV基因家族分为9个亚族。分析显示，同一亚族RAV基因具有相似结构域、基因结构和motif分布。共发现87个共线性基因对，其中Zm-Oh43-RAV基因家族主要存在串联重复基因对，其他4个玉米自交...